水稻綿腐病在播后5—7天就有發生，主要危害幼根和幼芽，最初在稻谷穎殼處或芽莖基部出現乳白色膠狀物，逐漸向四周長出白色棉絮狀菌絲，后因為氧化鐵或藻類、泥土黏附而呈鐵銹色、綠褐色或泥土色，受侵染的稻種內部腐爛不能萌發。
綿腐病的病原菌有多種，最常見的有綿霉菌和腐霉菌。綿霉菌和腐霉菌寄生性較弱，主要在土壤中營腐生活，還普遍存在污水中，條件適宜菌絲或卵孢子產生游動孢子借水流傳播，侵染破壞稻谷或弱芽，病菌又不斷產生游動孢子進行再侵染。
水稻綿腐病發病條件：低溫多濕，在低溫多濕的情況下，稻芽生長弱，生長受到抑制，這時候破損種子和幼芽極易受病菌侵染。
鹽堿重或腐殖質多的土壤，也極易侵染綿腐病。
防治技術：精選種子，避免破損種子和糙米。
適時播種，提高播種質量，發生綿腐病要適時曬田，降低床面濕度。
進行土壤調酸和種子消毒，將土壤PH值調到5左右，稻種用惡苗凈浸種，用福美雙和甲霜靈拌種。
土壤消毒用1000倍硫酸銅溶液或5000倍液甲霜靈進行噴霧。
